1.水土保持功能
水土保持功能茂密生長在淡水河的水筆仔，會形成一道天然屏障，抵擋河水與潮汐侵蝕可以保護河岸，使其不受接河水與潮汐沖擊，極具水土保持之功效，而茂密的紅樹林也可以阻擋強勁的海風，或把河水泥沙擋下，主要是因根系(地下根、支柱根)對於維護堤岸有極佳效果。
2、生態功能
水筆仔沼澤區內來自上游及海洋所帶來支各種無機鹽及有機物，在加上水筆植物體本身枯枝落葉的掉落，經由真菌分解形成有機碎屑，使的區內沈積了大量有機養分。這些有機養料可以藉著潮水的漲退帶潮間帶與給沿岸的浮游生物利用，水筆仔是潮間帶生態系中最基礎的生產者。
3、環境保護功能
水筆仔因其特殊的形態特性，不僅可以攔截泥沙擴大灘地，有極佳的保安護岸功能。濕地不僅為無數生物庇護覓食之場所，以水筆仔沼澤區而言，水筆仔植物為該區土壤有機物之主要來源，土壤有機物增加，因此在紅樹林沼澤區內一旦紅樹林遭到砍除，土壤中的有機物即不再獲得補充，污染物直接釋放至水體，生存於河口的生物將受到波及，而潮間帶濕地土壤將會回復鹽化，影響整個生態系之平衡。
4、教育遊憩功能
水筆仔沼澤區動物種類繁多，為賞鳥觀蟹之最佳場所，透過設計良好的活動，人們可以了解大自然的奧祕，進而樂於親近自然，保護環境。若規劃成觀光遊憩區，更可寓教於樂，讓遊客帶一些生態保育的觀念回家。
5、過濾有毒物質
許多研究顯示紅樹林不僅為無數生物庇護覓食的場所，更是許多有毒物質的過濾器及營養貯存庫，為大自然最佳的濾水系統，它的過濾功能主要是透過濕地植的根吸收及土壤的緩衝能力。
 6、經濟功能
        水筆仔的生長快速，其木材可薪材，早期淡水民眾即常砍伐水筆仔為薪炭材，水筆仔的胎生苗含有大量的澱粉，早期的人作為醃製食品用，然今日無人使用。 水筆仔另一個名稱為水瓊花，發出淡淡的香味吸引昆蟲覓食，每年六、七月會開花在早期有養蜂人家在八勢里一帶水筆仔林養蜂採蜜。淡水人以前有人叫「海茄苳」，會利用紅樹的行業有二種，一種是養蜜蜂的人，利用紅樹所養的蜜蜂所產的蜂蜜是最好的。在一種是養羊的人，羊要吃很多的鹽分，紅樹含有的很多的鹽分，所以養羊的人都會砍一點，讓羊所產的羊奶是最棒的。